物流企業是在物流作業鏈中為外部客戶管理、控制和提供一整套物流服務的公司，通常被稱為第三方物流。成本核算方法是指將與成本核算對象相關的費用歸集并分配至該成本核算對象的具體方法，成本核算方法的不同將會對費用的歸集以及分配路徑產生重大影響，進而影響成本核算對象的最終成本數據。根據間接費用的分配標準不同，本文結合所在企業物流運作的實際，就采用營運成本法和作業成本法核算作一介紹。
     營運成本法 
     營運成本法來自于我國傳統交通運輸企業的成本核算方法，鑒于物流企業業務活動與交通運輸企業業務活動之間的密切聯系，這里按照現行成本核算原則和方法將物流企業物流成本核算的方法界定為營運成本法。
     作業成本法 
     20世紀80年代后期，庫伯和開普蘭提出了以作業為基礎的成本計算法（Activity Based Costing，簡稱ABC）。ABC是現代管理會計的發展趨勢，與傳統成本法的不同之處在于間接費用的分配，使得成本核算更加精確化。 
     依據“作業消耗資源，產品消耗作業”原理，基于作業的物流成本核算可分為如下四步：一、界定企業物流系統涉及的各項活動，典型分析客戶訂單、渠道、物流業務和增值服務活動等。二、確認企業物流系統涉及的資源，包括人、財、物各方面的消耗。三、確認資源動因，將資源分配到作業中。四、確認成本動因，將作業成本分配到物流業務或服務中。 
     假設物流企業同時承做兩項物流業務，營運成本法下的核算思路是：對于能夠直接計入某一項物流業務成本的直接費用直接計入該項物流業務成本，對于不能直接計入某一項物流業務的間接費用則選擇單一的分配標準分配計入這兩項物流業務的成本。作業成本法下核算思路是：將整個物流業務運作過程細分為多個作業，如運輸作業或倉儲作業等；根據運輸資源的耗費和運輸作業量計算單位作
業成本；確定不同物流項目實際耗用不同作業的數量；根據單位作業成本和物流項目耗用的作業量計算物流項目的作業成本。