醫藥物流倉儲就是醫藥行業的物流和倉儲，主要就是藥品的流通和存儲。但對于醫療行業來說，畢竟是事關人類健康的行業，所以無論是哪個環節對它的要求都會更加地嚴格，物流倉環節自然也不例外。
目前很多的藥物流通企業會運用物流規劃技術和系統集成技術，應用物流輸送技術和倉庫管理系統，為客戶提供了全方位自動化的物流解決方案，物流這塊發展得不錯。
但醫藥倉儲這方面卻還有許多的問題亟待解決，GMP對藥品的倉儲有著十分嚴格的要求，不但存儲環境要達到各種條件，而且對于倉儲的管理系統也有著很高的要求。因此，當前藥品的倉儲就存在著一些難題。
第一、藥品的質量管理要求作業規范。藥品的倉儲管理中最重要就是藥品的質量管理，主要體現在藥品存儲的操作規范性操作，藥品的養護工作等。
第二、藥品批號管理難度很大。同一種藥品有多個批號，而且這個批號對于藥品經營企業來說很重要，其必須要準確的掌握每一批號藥品的進貨量、銷貨量和存貨量
第三、醫藥物流行業人才缺乏。醫藥物流行業特別是藥品倉儲方面，涉及到如質量、物流、信息化等各個方面，總體來說對人才的要求較高。
未來，智能物流倉儲管理系統市場完全成熟，醫藥物流行業的發展還會更快，更多的醫療物流倉儲中相關的問題也必然會通過技術、政策等方式得以解決。這也就意味著，醫藥物流行業會隨著智能物流倉儲的興起而迎來變革。
醫藥物流發展趨勢
在用戶需求上主要體現在4點上:
1、從原來追求物流中心的存量，到現在追求存量的同時對也追求物流中心的吞吐能力。
2、從大批量出庫或者大分銷模式，到現在越來越注重終端拆零。這也是醫藥新政出來以后，包括“兩票制”、疫苗的“一票制”一系列的政策引導，包括現在市場的終端化導致從原來批量出庫需求到現在拆零的需求大幅度提升。
3、服務由傳統到個性化。原來大家關注的是傳統的倉儲、配送，現在有更多的個性化物流服務需求，例如現在談得比較熱的院內物流，這實際上是物流的延伸，未來會不會到樓層物流，這是趨勢上面的問題。如果放棄這塊服務有可能意味著放棄這塊市場。從物流發展來看，未來的個性化服務包括增值服務是物流必然需要滿足的地方。
4、醫藥行業物流理念在轉變。從原來注重局部物流到現在關注的是一張網。局部物流是什么概念?我建一個倉，關心的是這一個倉。而現在關注的是一張網。